El Presidente Ejecutivo de la Cámara de Comercio de San José es el doctor JOSÉ JOAQUÍN MARTINEZ ZUBIETA.
Ejerce la representación legal y vocería de la institución, actúa como jefe de los servicios administrativos, ejecuta las órdenes de la Junta Directiva.
Organiza, dirige y orienta el funcionamiento y manejo eficiente de los registros públicos, dirige y supervisa las labores de promoción y desarrollo, elabora el programa anual de trabajo y el proyecto de presupuesto anual de ingresos y egresos, ordena los gastos incluidos en el presupuesto de cada vigencia, nombra y remueve libremente el personal bajo su dirección, rinde en forma oportuna un informe a la Junta Directiva acerca de las labores realizadas en cada año, entre otros.